GenoTropics
Rede BioGenomas Neotropicais
Começando pelo Brasil, nossa rede tem como objetivo fortalecer a pesquisa genômica nos Neotrópicos e promover ações de conservação da biodiversidade por meio de:
Geração de genomas de alta qualidade para espécies neotropicais, com forte participação e liderança de cientistas dos Neotrópicos;
Ativação e engajamento de pesquisadores da diáspora científica latino-americana e da comunidade internacional com expertise em genomas de referência, promovendo apoio colaborativo a grupos de pesquisa neotropicais;
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Armazenar amostras biológicas em coleções científicas no Brasil para estudos futuros, promovendo a continuidade da pesquisa e mantendo o elo com o país
Estimular conexões globais para participação de pesquisadores brasileiros no exterior, envolvendo iniciativas nacionais e internacionais
Estimular conexões globais para participação de pesquisadores brasileiros no exterior, envolvendo iniciativas nacionais e internacionais
Espécies alvo
Sucupira Branca Pterodon pubescens Benth
Limpa-folha-coroado Philydor atricapillus
Tamanduá-bandeira
Myrmecophaga tridactyla
Joaninha beiçuda
Crenicichla sp.
Os genomas serão montados considerando os seguintes passos:
For sample collection, access to genetic heritage, ethics committees and others
Obtain licenses
Appropriate sampling protocols for each species and biological tissue collected, ensuring cold chain during sample transportation and shipment
Sample collection & shipment
Using technologies such as ONT, PacBio HiFi and Hi-C
Long read sequencing
Scaffolding step
Generation of Hi-C libraries
Bioinformatics for genome assembly
Assembly
Funding
